Τον πρώτο της τίτλο ύστερα από 19 χρόνια κατέκτησε η ΑΕΚ του Ντούσαν Ίβκοβιτς στις 2 Απριλίου του 2000. Στον τελικό αντιμετώπισε τον Πρωταθλητή Ευρώπης Παναθηναϊκό, επικρατώντας με 59-57 στο τότε νεόκτιστο κλειστό γήπεδο του ΠΑΟΚ. Κορωνιός και Τσακαλίδης ήταν οι πρώτοι σκόρερ της Ένωσης με 12 πόντους έκαστος. Από πλευράς ηττημένων είχαν ξεχωρίσει οι Ρέμπτρατσα, Κάτας και Μποντιρόγκα με 18, 12 και 11 πόντους αντίστοιχα.
Διαιτητές: Κορομηλάς, Κουκουλεκίδης
ΑΕΚ (Ίβκοβιτς): Μισιακός, Χάνσελ 2, Χατζής 2, Κορωνιός 12(2), Ντικούδης 4, Τσακαλίδης 12, Μιούρσεπ 9(1), Μπούι 8(1), Κακιούζης 10(1), Παπανικολόπουλος, Ο’ Σάλιβαν.
Παναθηναϊκός (Ομπράντοβιτς): Αλβέρτης 2, Καλαϊτζής 2, Ρότζερς 5(1), Φώτσης, Τζεντίλε, Μποντιρόγκα 11, Μπουντούρης 3(1), Ρέμπρατσα 18, Μπερκ 4, Κάτας 12, Κοχ, Γλυνιαδάκης.
Ο πρώτος μετά το 1981
Με αυτό το Κύπελλο ο Δικέφαλος πανηγύρισε τον παρθενικό του τίτλο μετά το 1981, Τότε με προπονητή τον Φρεντ Ντέβελι είχε κάνει δικό του το πρώτο του Κύπελλο Ελλάδος απέναντι στον Ηρακλή, με τον Βασίλη Γκούμα να σημειώνει 30 πόντους και τον Κερτ Ράμπις να αναδεικνύεται MVP.